O podobě Rudolfa II. máme dobrou představu na základě četných soudobých vyobrazení, reliéfů a soch. Většinou se shodují s kosterním podkladem.

Reliéfní vyobrazení na stříbrné medaili od Antonia Abondia, okolo r. 1580, průměr 45 mm, numizmatická sbírka Národního muzea v Praze