O velké rodině a sirotcích
Informace o dění ve světě a pokyny k činnosti přijímá buňka prostřednictvím signálních molekul – hormonů. Jsou to látky různé chemické podstaty a biochemického původu, od oxidu dusnatého přes metabolity mastných kyselin, steroidy, modifikované aminokyseliny, aminy a krátké peptidy až po bílkoviny.
Tentýž hormon může různé druhy buněk ponoukat k rozdílným činnostem nebo jim být naprosto lhostejný. Záleží na tom, jestli má pro něj buňka receptory, a na tom, jakou odpověď má předem přichystánu.
Receptor je bílkovina, která je schopna specificky vázat svůj ligand (hormon nebo jinou molekulu) a díky vazbě změnit uspořádání tak, že spustí určitý sled biochemických reakcí. Vždy jde o poměrně složitou sekvenci, jíž se účastní spousta dalších molekul. Výsledkem je nějaký životní projev buňky. Něco se začne syntetizovat nebo naopak odbourávat, buňka vstoupí do další fáze buněčného cyklu nebo třeba programovaně zahyne.
Nová skupina členů velké rodiny dostala jméno sirotčí receptory (orphan receptors). Během deseti let bylo objeveno a podle příbuzenských znaků setříděno do 19 podskupin množství sirotků – sirotčí receptory se staly nejpočetnější skupinou jaderných receptorů vůbec.
Pátrání po ligandech pro sirotčí receptory je pro některé nadšence disciplínou stejně vzrušující jako pro jiné hledání Eldoráda nebo svatého grálu. Hledač musí počítat s možností, že právě pro jeho oblíbence žádný endogenní ligand neexistuje. Ale co kdyby…? Sirotek se pak přesune mezi „slušné receptory“ pojmenované po ligandu, jehož objevitele čeká vědecká sláva a hojná citovanost.
Klasická endokrinologie rozdělila steroidní hormony do pěti hlavních skupin, a nakonec poznala i jejich receptory. „Převrácená endokrinologie“ nalezla receptory i pro další steroidy, které byly dosud pokládány za neaktivní meziprodukty nebo metabolity nejasného fyziologického významu, a identifikovala alespoň některé geny, které jsou jimi řízeny. Podobně byly nalezeny i receptory pro mastné kyseliny.
Hledání odpovědí na takové otázky vyžaduje spolupráci mnoha týmů – kvůli šíři záběru i kvůli nezbytnosti nezávislého ověření nových poznatků. V jedné rozsáhlé studii byly navrženy sady primerů pro PCR tak, aby umožnily identifikovat sekvence příbuzné třinácti hlavním skupinám jaderných receptorů. Pomocí těchto primerů byly pak prozkoumány DNA z vybraných živočichů, rostlin i hub. Pokud jde o rostliny, houby a prvoky, byl výběr spíše jen sondou do různých oblastí. Mnohobuněčná část živočišné říše Metazoa však byla probrána systematicky. Nalezené sekvence byly analyzovány a seřazeny do pravděpodobného fylogenetického stromu.
A jak to dopadlo? Žádné náznaky existence genů pro jaderné receptory nebyly nalezeny v rostlinách, houbách (Fungi), prvocích apod., tedy mimo Metazoa. Nalezeny nebyly ani ve vodních houbách (Porifera), které už mezi Metazoa řadíme. Počínaje láčkovci byly jaderné receptory nalezeny u všech živočichů. U některých receptorů se dají příbuzenské linie dále sledovat. Na rozdíl od sirotčích receptorů nemají často receptory s ligandy, které nacházíme u obratlovců, homology v ostatních částech živočišné říše. Z toho se dá usuzovat, že receptory s ligandy jsou vývojově mladší. První člen rodiny jaderných receptorů se objevil nejméně před 600 miliony lety – a byl to sirotek.
Nikdo asi už sirotčím receptorům jejich jméno neodpáře, i když ze současných poznatků plyne, že nejsou osiřelé, nýbrž jenom osamělé. Svůj ligand neztratily, nikdy žádný neměly. To „obyčejné“ receptory získaly během fylogeneze tu neobyčejnou vlastnost aktivovat se vazbou určité látky. Za určitých podmínek se receptory mohou aktivovat i v nepřítomnosti ligandu. „Doména s kapsou“ změní svou konformaci třeba díky vyšší teplotě, koncentraci určitých iontů v roztoku nebo fosforylaci postranního aminokyselinového řetězce. Tyto způsoby aktivace nezávislé na ligandu, které známe i u receptorů pro steroidy, patrně využívaly původní jaderné receptory, a ty dosud nezadané je využívají dodnes.
Steroidy jsou mnohem starší molekuly než jejich receptory. Vyskytují se i v houbách a rostlinách, organizmech, které jaderné receptory nemají. Totéž platí pro mastné kyseliny. Tyto látky byly na světě dříve, než se vůbec objevily první sirotčí receptory, jejichž potomci je později začali rozpoznávat.
Naopak některé receptory jako by čekaly, až se jejich ligand v organizmu teprve vyvine nebo přijde odjinud. Určitá léčiva a další cizorodé látky, nepodobné čemukoli, co vzniká v organizmu obratlovců, působí prostřednictvím „svých“ sirotčích receptorů. Zvláštní je také schopnost estrogenových receptorů rozpoznávat vedle vlastních steroidních estrogenů i produkty fenylpropanoidové větve metabolizmu, která se vyskytuje jen ve vyšších rostlinách. Co bylo dřív?
Ať už se jednotlivé ligandy vyvinuly dříve nebo později než jejich receptory, podstatný je poznatek, že se mohly vyvíjet zprvu odděleně. Teprve v určitém stupni evoluce začaly spolu vytvářet vzájemně propojené sítě vztahů, jak je známe z dnešních organizmů.
Literatura
S. A. Kliewer, J. Lehman, T. Willson: Orphan nuclear receptors: Shifting endocrinology into reverse, Science 284, 757–760, 1999H. Escriva, F. Delaunay, V. Laudet: Ligand binding and nuclear receptor evolution, BioEssays 22, 717, 2000
receptors.ucsf.edu/NR/
/> www.ens-lyon.fr/LBMC/laudet/nomenc.html
/>
Poznámky
Citát
Václav Baran, Jaderná energetika a další problémy moderní civilizace,
Academia, Praha 2002, s. 114
Ale ani úspěšná teorie v jednom ohledu nevylučuje možnost omylu v jiném – dokladem budiž znovu Mendělejev a jeho periodický systém. Bravurně dokázal na jeho základě vlastnosti tehdy neznámých prvků, ale jen ve třech případech (gallium, skandium, germanium), čtvrtý (ekaniob čili tantal) se mu nezdařil. Za prvé tři je právem dodnes vyzvedán, čtvrtý uvádějí už jen historici. Ale nejen to, Mendělejev dokonce ani nepředpokládal, že prvky začínají vodíkem, a hledal hmotnost menší než 1, což dokazuje, že ani tak skvělý autor nemusí mít zcela jasno v tom, oč se pokouší …
Receptor musí vykonávat několik funkcí a ty musí být navzájem sladěny. Ve struktuře jaderného receptoru je možno vysledovat úseky, které odpovídají za ligand (pevnou vazbu proteinu k jiné molekule; z lat. ligere – vázat), interakce s jinými proteiny či s obecnou strukturou DNA a také za rozpoznání specifických sekvencí DNA. Další dílčí funkce jsou odpovědné za jejich koordinaci. Úseky na molekule proteinu, kterým je možné přiřadit dobře definovanou dílčí funkci, se nazývají domény.
Jednotlivé skupiny jaderných receptorů se nejvíc liší ve výstavbě N-koncové části molekuly, která je proto považována za evolučně mladší prvek. Naproti tomu doména odpovědná za vazbu receptoru k DNA je nejvíce konzervativní (v ní jsou si jaderné receptory všech živočichů podobné). V této doméně jsou vždy dva „zinkové prsty“ obsahující čtyři zbytky sirné aminokyseliny cysteinu, které po koordinaci zinečnatých iontů stabilizují prostorové uspořádání. Kromě hlavních domén jsou v jaderných receptorech oblasti nezbytné pro interakce s dalšími proteiny a pro sladění jednotlivých funkcí.
Transkripce genů vyžaduje spolupráci řady molekul organizovaných v transkripčním komplexu. Jaderné receptory hrají klíčovou roli – rozpoznávají totiž specifické úseky DNA (hormon-responzivní elementy, HRE), které označují jednotlivé geny. Ostatní součásti transkripčního komplexu jsou víceméně univerzální. Jestliže má receptor plnit svou úlohu, musí obsahovat místa pro spolupráci se všemi partnery. A pokud jsou ostatní členové komplexu univerzální, je potřeba, aby byly příbuzné jaderné receptory v interakcích zaměnitelné, tj. aby se příslušné domény příliš nelišily.

















